Innodb數據庫對于已經刪除的數據只是標記為刪除，并不真正釋放所占用的磁盤空間，這就導致InnoDB數據庫文件不斷增長。
如果在創建數據庫的時候設置innodb_file_per_table=1，這樣InnoDB會對每個表創建一個數據文件，然后只需要運行OPTIMIZE TABLE 命令就可以釋放所有已經刪除的磁盤空間。
運行OPTIMIZE TABLE 表名后，雖然最后會報Table does not support optimize, doing recreate + analyze instead，但其實已經成功了：）
如果沒有設置這個參數，又想釋放空間，徹底釋放這些已經刪除的數據，需要把數據庫導出，刪除InnoDB數據庫文件，然后再倒入。
下面是基本的步驟：
1 使用mysqldump命令將InnoDB數據庫導出
2 停止MySQL
3 刪除所有InnoDB數據庫文件和日志
4 啟動MySQL并自動重建InnoDB數據庫文件和日志文件
5 導入前面備份的數據庫文件
具體命令：
# 備份數據庫：
mysqldump -uroot -proot --quick --force --all-databases > mysqldump.sql
# 停止數據庫
service mysqld stop
# 刪除這些大文件
rm /usr/local/mysql/var/ibdata1
rm /usr/local/mysql/var/ib_logfile*
# 手動刪除除Mysql之外所有數據庫文件夾，然后啟動數據庫
service mysqld start
# 還原數據
mysql -uroot -proot < mysqldump.sql
